魏晋时代政权更迭频繁，战乱不息，政治黑暗。曹爽、司马懿、司马昭等为了自己的利益，争相拉拢名士出仕，而皇甫谧和嵇康、阮籍等名士，以正气凌暴虐，不肯降志辱身，拒绝出仕，乃至逃官、弃官，嵇康因此付出了宝贵的生命。皇甫谧和反抗“窃礼教以杀人”宗族势力的才女香蘅、逃出深宫的贵人云娘之间的生死恋情，以及嵇康与长乐亭公主波澜横生的传奇般的至爱。

魏晋时期,皇宫突发一起血案，宫女英慧在双亲被杀，英慧携带青囊经从皇宫出逃，皇上命王赞、司马魁共同追查。皇甫谧与师傅刚给太子看完病，赶着封赏马车回家，途中与追查官兵相遇，正寒暄之时，宫女乘机躲进马车里。司马魁嘱咐手下，一定要先找到英慧。善珍师傅带着金银绸缎等封赏回来了。众弟子急忙从房间起来迎接。宫女乘机从马车里出来逃跑。

故事背景设定在古代王朝时期，王朝内外纷争不断，人民生活困苦。在这个动荡的时代，出现了一位传奇的医者，他就是皇甫神医。皇甫神医精通医术，医术高超，医治疑难杂症无所不能，拥有医术天赋的他被誉为神医。

故事开始，皇甫神医在一个偶然的机会下被王朝皇帝的使者相中，被邀请入宫为皇帝治病。皇甫神医以他的医术治愈了皇帝的重病，赢得了皇帝的赏识和信任。从此，皇甫神医成为了宫廷中备受宠爱的人物，被赋予了很多医疗事务的职责。

然而，皇甫神医并不满足于在宫廷中治疗病人。他深知人民苦难，决心要用自己的医术造福天下，改善人民的生活。他离开宫廷，四处行医，治疗百姓疾病，缓解他们的痛苦。在他的帮助下，很多本无希望的病人康复了，人们对他充满了感激之情。

然而，皇甫神医的崛起并没有得到所有人的认同和支持。一些宫廷权臣觉得他的影响力过大，开始对他心生嫉妒和恶意。他们纠集一些医者与皇甫神医为敌，试图打压他的声望和地位。皇甫神医面临着巨大的挑战，他必须面对暗潮涌动的宫廷权谋，保护自己和他的事业。

在剧中，观众将见证皇甫神医在宫廷中的风云际会，以及他对人民的深情厚意。剧情紧凑，情节扣人心弦，充满了悬疑、荣辱与爱恨交织的故事。通过皇甫神医的奋斗和努力，他不仅改变了自己的命运，也为整个王朝带来了希望与变革。

《皇甫神医》以其独特的叙事方式和精彩的演绎，展现了一个医者的崛起与抗争的故事，同时也反映了古代社会的政治斗争和医疗体系。这部剧既有扣人心弦的剧情，又有丰富的历史背景，给观众带来了一场视听盛宴。