1999年，某(🐽)个东(dōng )西(📒)被卡车运出了馆山市。几天后，哥斯(sī )拉登(dēng )(🔧)陆了馆山，特(tè )生自卫队出动与之展开(kāi )了苦战。在战斗中，自卫队(😎)员家(🖲)城(chéng )茜(qiàn )（釈由美子 饰）意外害死(🙍)了战友叶山二尉(🏐)（(🚥)森末慎(shèn )二 饰(shì )），自己却(✖)侥(🙁)幸活了下来，并被派去了(🤷)资料科(⏺)。　(🌙)　另一方(🔩)面，日本政府在柘植真智(zhì )子首相（水野(🥎)久(jiǔ )美 饰）的指挥(huī )下，召集了汤原德光（宅麻(⛓)伸 饰(🈴)）等科学家开始研(🚻)究(jiū )(🤲)对付哥斯拉(lā )(👺)的(⛳)G兵器。他们(🐀)以(yǐ )(🧟)在馆山冲挖(🕯)掘(jué )出来的初(🈁)代哥斯拉骨(🏉)骼(gé )为基础(🛎)，用了(le )四(sì )年制成(chéng )了机(🐛)械(🌹)哥斯(sī )(🐨)拉(👪)——3式(shì )机龙。柘植(zhí )首相辞职(zhí )，由(yóu )科学技(jì )术厅(tīng )长(zhǎng )官五十岚隼人（中尾彬(bīn ) 饰(shì )）就(jiù )任新(xīn )首相。同时(🚲)，茜被派去(🌱)了机龙队，担任机龙的操作员(🚽)。　　就在(zài )准(zhǔn )(😳)备机龙测试机动时(👚)，哥(⏺)斯拉又(yòu )在东京湾出现了。机龙(lóng )赶(gǎn )赴(⛴)现(xiàn )(🏸)场与(💁)哥(gē )斯拉对战，却因哥(🍯)斯拉的吼(hǒu )(🈂)声(🚪)唤醒了体(💛)内(👼)的野兽灵魂，突(tū )然(rán )暴走，在(🕵)城市中(📯)造成了大(dà )破坏。　　为了(le )改良机龙，汤(🍈)原改变了机龙DNA计算机的(de )碱(jiǎn )构(🍗)造，使机龙不会(👡)再受(🐼)哥(gē )斯(sī )拉(lā )叫(jiào )声(shēng )(📸)的干扰。但由于(yú )对再(zài )次(🔰)暴(bào )(🍂)走的(de )担(📳)忧，五十岚(👎)迟迟(chí )不允(🔚)许出动(dòng )(🤳)机龙。　　哥斯拉再度出(chū )现在东(dōng )京湾，一路无视特生自卫队的攻击来到了品川，令城市变(🛥)成(🐊)了一(yī )片火海。面(🥘)对如此情景，五十(🈲)岚终(🥡)于同意(yì )(🛍)让机龙出(chū )动。　　为了(le )打(🙋)败哥斯(sī )拉(💙)，机龙被送(🚄)到了品川。茜也(🍑)抱着(zhe )必死的觉(jiào )悟。机龙(🗄)和茜的(🎅)战斗就这样开始了。